La trama se complica en ' Duna: Profecía ' a medida que el ajuste de cuentas profetizado se acerca cada vez más, amenazando el delicado equilibrio del Imperio y desafiando el poder que la Hermandad tiene sobre él. Con La creciente influencia de Desmond Hart Sobre el Emperador, la madre superiora Valya idea un nuevo plan para desafiar su estatus y recuperar el poder. Regresa a casa y se encuentra con su tío y su sobrino, quienes ahora gobiernan la Casa Harkonnen. Mientras tanto, surgen problemas en Salusa Secundus a medida que toma forma un complot rebelde, que Valya espera que cambie el rumbo a su favor. SPOILERS ADELANTE
Con todo lo que ha sucedido, Valya sabe que la única manera de recuperar al Emperador es a través de algo muy significativo. A través de su espía, la hermana Mikaela, descubre un complot rebelde para volar el palacio durante la próxima reunión del Landsraad. La explosión se producirá con la ayuda de una máquina pensante. Valya planea destruir la máquina justo a tiempo para evitar la explosión y salvar al Emperador, así como a todos los líderes de las Grandes Casas que están allí para asistir a la reunión. Pero para eso, ella necesita estar allí en persona, que es donde Harrow Harkonnen entra en escena.
Tras la guerra contra las máquinas, los Harkonnen se exiliaron en Lankiveil. No están invitados al Landsraad, por lo que a Valya se le ocurre un plan. Utiliza a las Hermanas, que son colocadas como Decir la Verdad para otras Casas, para plantar la idea de un encubrimiento de la muerte del joven Pruwet Richese. Las Hermanas aconsejan a los Lores que hablen en contra de la Casa Corrino, acusándolos de asesinar al niño Richese y luego guardar silencio al respecto. Sin embargo, es un riesgo enorme culpar al Emperador por un crimen, por lo que necesitan a alguien que pueda asumir ese riesgo por ellos. Todos los dedos apuntan hacia la Casa Harkonnen.
Si bien su tío desconfía de sus ideas, Valya logra convencer a Harrow de seguir adelante con su plan, aunque no le cuenta la esencia completa del mismo. Hasta donde Harrow sabe, ha conseguido que la Madre Superiora de la Hermandad sea su Decir la Verdad personal, lo que ya le da suficiente peso a su presencia en el Landsraad, lo cual es un logro en sí mismo después de que dos líderes de diferentes Casas lo invitan personalmente. Animado por Valya, Harrow sube al escenario el día de la congregación. Pide una investigación formal sobre la muerte de Pruwet Richese. Pero antes de que pueda señalar con el dedo al Emperador, la Princesa Ynez se acerca y lo hace por él. A partir de aquí, nada sale como Valya había planeado.
Mientras las cosas van mal en Salusa Secundus, algunos acontecimientos muy inquietantes tienen lugar en Wallach IX. En medio de la noche, casi todas las hermanas, excepto Jen, tienen un sueño sobre su muerte, muy parecido a cómo mataron a la hermana Dorotea hace tantos años. Cuando Tula intenta comprender su sueño, todos dibujan lo mismo, que apunta hacia Shai-Hulud, el gusano de arena. Las Hermanas lo interpretan como los ojos de Dios y un juicio que cae sobre ellas por sus pecados. Esto aterroriza a Tula, ya que tiene una buena cantidad de sangre en sus manos.
Mientras Tula intenta comprender lo que está pasando, también reza para que Lila vuelva a la vida. En el episodio anterior , había puesto a la niña en manos de la IA secreta, Anirul, con la esperanza de que la especia pudiera traerla de regreso. Su teoría también se ve reforzada por la parte de la profecía que habla de los nacidos dos veces y de su segundo nacimiento proveniente de la especia. Valya cree que se refiere a Desmond Hart, pero no tiene idea de qué ha estado haciendo Tula en su ausencia. Después de esperar mucho tiempo y ser perseguida por sus demonios en el proceso, el deseo de Tula se hace realidad.
Después de una visión aterradora, en la que la encuentra la hermana Jen, a quien tiene que degollar, Tula se despierta y encuentra vacía la máquina donde había mantenido a Lila. La visión también hace referencia a la muerte de Sor Dorotea, mezclada con las visiones que también tuvo Madre Raquella. Pero todo eso se desvanece de la mente de Tula cuando descubre que la especia y la máquina han hecho su trabajo, y Lila ahora vuelve a la vida. Una clara señal de picante aparece en sus ojos, que ahora han adoptado el azul característico de los ojos de Arrakeen. Lila parece confundida acerca de su resurrección, pero lo que la sorprende aún más es ver a Anirul en todo su esplendor. Queda por ver cómo la han cambiado la Agonía y la resurrección, pero seguro que encaja en los criterios del ajuste de cuentas prometido por la profecía.
En Salusa Secundus, las cosas empeoran cuando, a pesar de ser acusado de asesinato, Desmond Hart le da la vuelta a todo. Confiesa que, de hecho, mató a Pruwet Richese, pero lo llama una ejecución por usar la máquina pensante. También presenta a los rebeldes que habían planeado volar el Landsraad, arrebatando otra victoria directamente de las manos de Valya. Por orden del Emperador, mata a los rebeldes y a un líder de una Casa, y la demostración de poder hace exactamente lo que la Emperatriz Natalya esperaba. Sin embargo, también desilusiona a Ynez por el repentino giro que parecen haber tomado sus padres.
Ahora, ni la bomba explota ni el Emperador es puesto bajo escrutinio por mantener a un asesino como Desmond Hart cerca de él. Una Valya derrotada, junto con un Harrow abatido, regresa a casa, donde su tío la ridiculiza una vez más. Reprende a Harrow por seguir adelante con el plan de Valya, creyendo que ella lo estaba ayudando cuando todo lo que hizo fue ayudarse a sí misma. El joven barón, sin embargo, no está de humor para escuchar nada en este momento, así que se marcha. Más tarde esa noche, Valya encuentra a su tío y lo confronta por haber hablado contra ella fuera de turno. Una vez más, la culpa por la muerte de Griffin y utiliza la lealtad de Tula para ponerla en contra de la familia.
Él culpa a su ambición por todo lo que salió mal hace tantos años, pero Valya se aferra a la creencia de que si se hubiera permitido que su ambición tomara forma, la Casa Harkonnen habría gobernado el Imperio. Su ira y odio la llevan a ocultarle el inhalador de su tío, que es necesario para seguir con vida. Cuando no recibe la ayuda que necesita, muere justo delante de ella, y esto es exactamente lo que Valya quería. Pero su racha de asesinatos no termina ahí.
Cuando Valya se unió a la Hermandad, renunció a su amor por la Casa Harkonnen, especialmente después de que Tula mató a Vorian Atreides y Griffin fue vengado. Como la Bene Gesserit es su única familia, no le importa a quién tiene que sacrificar y convertir en un trampolín para dar lo que quiere. Es su odio por la Casa Harkonnen lo que le impide darles un Decir la Verdad, aunque sabe que lo necesitan desesperadamente. Ella solo acude en su ayuda cuando cree que le serán de alguna utilidad. Ahora que los Harkonnen están en Landsraad, Valya necesita que estén completamente bajo su control, especialmente después de la debacle en Salusa Secundus.
Valya sabe que mientras su tío esté vivo, no podrá controlar por completo a los Harkonnen. Entonces ella lo mata. Luego, tiene a Harrow. Sin su tío, Valya tendrá control sobre él, pero no tiene lo necesario. Aunque ella le guíe, él es quien tendrá que actuar. Con lo que sucede con el Landsraad y cómo Harrow se queda corto, Valya necesita a alguien en su lugar que no sólo sea inteligente sino que también esté completamente bajo su mando. Entonces, hace matar a Harrow y coloca a su confiable hermana Theo en su lugar.
Con la desaparición de dos líderes de la Casa Harkonnen, se levantarían sospechas. Si bien la muerte del tío podría descartarse como mala salud en la vejez, la muerte de Harrow no se consideraría más que un asesinato. Curiosamente, Valya tiene una solución a ese problema. Resulta que Theo tiene un poder secreto y puede tomar la forma de cualquier persona que desee. Ella es una bailarina facial. Este es el secreto de su pasado al que se hacía referencia en un episodio anterior, y Valya lo supo desde el principio. Por eso trajo a Theo a Lankiveil. Esto es lo que había planeado desde el principio: que Theo ocupara el lugar de Harrow y que la Casa Harkonnen estuviera completamente bajo su mando.